据了解，澳大利亚最早是从上世纪的1996年开始种植转基因棉花，并从转基因棉花籽中加工出棉籽油，在各地销售用于烹饪。另外，转基因油菜的大量种植，是在2008年，目前新南威尔士州、维多利亚州和西澳大利亚州都有种植。菜籽油被用于生产人造奶油或罐装食品及零食，油菜籽粕和棉籽粕都被用来饲养牲畜。
在澳大利亚出售的转基因食品，无论是整件食物，还是只用于食品加工的材料之一，如果这些添加的基因材料或蛋白质会存在于最后的食物中，必须获得转基因情况证明。不过，也包括下述特例：
1. 食物中的转基因成分已获得高度精制，如食用油、人造奶油、糖、淀粉、巧克力、烘烤的食物。许多深加工食物都归属这一类。
2. 面包房、餐馆和快餐店制作的食品。
3. 用转基因食品饲养的动物制品。
4. 根据澳大利亚转基因食品标签法，若食品中含有的转基因有机体不超过1%，则无需在标签中备注。
据澳大利亚民族媒体SBS报道，在澳洲生产的转基因食品仅有棉籽油和菜籽油，但仍有品种繁多的转基因食物从海外进口而来，多数为袋装食品，它们并不需要在标签上备注“转基因产品”字样。
澳大利亚新西兰食品安全局允许食品厂商在进口食品中大范围采用转基因材料，其中包括转基因黄豆、玉米、大米、土豆和甜菜等。其中，转基因黄豆是用来生产多种食品的原料，例如面包、点心、巧克力、薯片、人造奶油和蛋黄酱等，大豆卵磷脂在酱料、蛋糕和糖果食品中被用作粘合剂。
此外，澳大利亚正在试种转基因菠萝、木瓜、小麦、大麦和甘蔗，以在植物的防虫、除草剂耐性、颜色、产油量、甜度以及开花和结果等方面获得更好的效果和产出。针对香蕉、大米和玉米，澳大利亚也正展开基因科技试验。
