按照菌落形态，真菌可分为酵母菌（yeast）和霉菌（mold）两大类，前者菌落呈乳酪样，由孢子和芽生孢子组成，后者菌落呈毛样，由菌丝组成，故又称为丝状真菌。有的致病真菌在自然界或25℃培养时呈菌丝形态，而在组织中或在37℃培养时则呈酵母形态，称为双相真菌。
根据真菌入侵组织深浅的不同，临床上把引起感染的真菌分为浅部真菌和深部真菌。
1、浅部真菌：浅部真菌主要指皮肤癣菌（dermatophyton），包括毛癣菌属（Trichophyton）、小孢子菌属（Microsporum）和表皮癣菌属（Epidermophyton），其共同特点是亲角质蛋白，侵犯人和动物的皮肤、毛发、甲板，引起的感染统称为皮肤癣菌病（dermatophytosis），简称癣（tinea）。目前浅部真菌病仍按发病部位命名（如头癣、体癣、股癣、手癣和足癣等），少数按皮损形态的传统命名，如叠瓦癣、花斑癣。皮肤癣菌病为接触传染，不洁的卫生习惯、多汗浸渍、共用拖鞋、毛巾、梳子及接触患癣的动物是皮肤癣菌传播的主要途径。
1、坏死
这是一种常见的症状，它表现为局部细胞和组织的死亡；如棉花苗期炭疽病、立枯病都造成叶片或根部坏死而出现死苗。小麦根腐病、纹枯病造成根部或根部叶鞘坏死，小麦白粉病、锈病（又叫黄疸）造成叶片坏死，赤霉病则造成穗部坏死等。
2、腐烂
是在细胞或组织坏死的同时伴随着组织结构的破坏，如茄子绵疫病、地瓜软腐病、西葫芦灰霉病等。其症状都是腐烂。
3、萎蔫
农作物由于受到病原体的侵染造成根部坏死或造成植株维管束堵塞而阻止水分的向上运输，使农作物缺水而引起植株萎蔫，这种萎蔫往往经过几次反复而使植株死亡，而有的症状轻微的则可缓和。如棉花、茄子的枯萎病、玉米的青枯病等。真菌病害造成的症状主要有以上这三种。
4、其他
真菌病害发生之后，除了以上这些症状之外，通常还出现其特定的病症，也即病原物在病部组织上的特殊表现。如黑色小颗粒、轮纹状霉层、絮状物等。如小麦黑穗病、玉米黑粉病都是在穗上出现粉粒，即病原菌的孢子。小麦白粉病在小麦叶片上出现白色的霉层，小麦锈病则在小麦叶片上出现红锈色的突起，也就是病菌的孢子堆。茄子绵疫病则是在茄果表面出现棉絮状的丝状物（并伴随着茄果软腐），这是病原菌的菌丝体。
一、鞭毛菌所致植物病害的主要特点
主要病状是：①组织增生；②幼苗猝倒；③植物各部分的腐烂；④叶片局部枯斑或枯焦；⑤花序、花梗畸形。主要病征为棉絮状物、霜霉状物、白锈状物等。
鞭毛菌引起的植物病害常见的有六大类：根肿病、猝倒病、疫病、霜霉病、白锈病和腐烂性病害。腐烂性病害往往按被害部位分别称为根腐病、茎腐病、基腐病和瓜果腐烂(绵腐)病等。
低等鞭毛菌如根肿菌常引起组织增生，使根茎部膨大或形成肿瘤，病部外表往往看不到病征，只能从病组织的切片中发现病原菌的菌体。引起植物病害的鞭毛菌绝大多数集中于霜霉目内。寄生性程度较低的类群，习居于土壤中，引起幼苗猝倒、根部与茎基部腐烂和瓜果腐烂等症状，其所造成的腐烂，大多数是软腐性的，蔓延十分迅速，可以很快使被害部位完全腐烂；寄生性程度中等的类群，可侵染植物各个部位，使植物叶片迅速坏死，根部或茎基部腐烂死亡，发生所谓“疫病(blight)”，它们引起的叶斑，大多数是水渍状斑或褪色斑，边缘无明显界限；寄生性程度高的类群，已发展为专性寄生菌，常使植物叶片出现褪色斑块或条纹，茎部和花序发生膨肿、徒长，叶变和畸形等症状，引起诸如“霜霉病”(downy mildew)和“白锈病”(white rust)等病害。
用杀菌剂进行拌种。清洁田园及时将病叶、病果清出园外，深埋或烧毁。轮作换茬，增施有机肥和磷钾肥。大棚或保护地加强通风，膜下浇小水，禁止漫灌，降低湿度。利用药剂代森锰锌、多菌灵、百菌清等防治，有一定的防治效果。
首先要对防治真菌病害的农药有个了解。如常用的百菌清、恶霜?锰锌、甲霜?锰锌、苯醚甲环唑、三唑酮、烯唑醇、多菌灵、甲基硫菌灵、代森锰锌、腈菌唑、戊唑醇、氟硅唑、乙膦铝、腐霉利、阿米西达等。
1、其中防治低等真菌病害的有：恶霜锰锌、甲霜锰锌和乙膦铝等；
2、防治高等真菌病害的有：苯醚甲环唑、三唑酮、腈菌唑、戊唑醇、氟硅唑、烯唑醇、多菌灵、甲基硫菌灵、腐霉利等。
3、对高等真菌和低等真菌病害都有效果的有：百菌清、阿米西达和代锰锌，其中百菌清和代森锰是保护剂。阿米西达是一个对低等、高等真菌都有杀灭活性的最广谱内吸性杀菌剂。
1、噻菌铜（龙克菌）：噻菌铜（龙克菌）在防治细菌性病害时，按照500—700倍稀释喷雾或者灌根或者泼浇或者拌种、浸种，是防治蔬菜（白菜、黄瓜、番茄）、果树（柑橘）、果类（西瓜）、烟草、兰花、棉花和水稻等9大农作物12个细菌性病害的新型理想药剂。
2、噻枯唑（叶枯唑）：对防治水稻细菌性条斑病和白叶枯病有效。由于在水稻上登记时间超过30多年，水稻已经产生了很大的抗药性，叶枯唑防治效果在不断地下降。由于登记企业过多，市场竞争无序，价格非常混乱，其已处于没落状态。
3、氢氧化铜：在水稻上未曾登记，在经济作物如蔬菜（黄瓜、辣椒和西瓜）、果树（柑橘、葡萄和荔枝）和烟草登记广泛，是常见的防治蔬菜细菌性病害的无机铜制剂。在花期和幼果期比较敏感，不可与酸性农药混用，宜单独喷洒。与春雷霉素的混剂对苹果、葡萄、大豆和藕等作物的嫩叶敏感，因此一定要注意浓度，宜在下午4点后喷药。由于登记企业比较多，价格悬殊大，真假难辩，市场也极其混乱。
