服用甲亢药物有副作用：
１、粒细胞减少：引起白细胞减少，发生率约为10%左右，严重者可发生粒细胞缺乏症（见于0.3～0.6%的病例）。主要发生在治疗开始后的2～3个月内，外周血白细胞低于3×109/L或中性粒细胞低于1.5×109/L时应当停药。但需要注意区分白细胞减少是甲亢本身所还是药物所致。治疗前和治疗后每周检查白细胞是必须的。
２、皮疹：发生率约为2%～3%。可先试用抗组胺药，皮疹严重时应及时停药，以免发生剥脱性皮炎。
３、胆汁淤积性黄疽、血管神经性水肿、中毒性肝炎、急性关节痛等不良反应较为罕见，如发生则需立即停药。
４、抗中性粒细胞胞浆抗体（ANCA）相关性血管炎，可累及全身多个器官如肺、肾、关节等，导致相应的器官组织功能障碍。如肾功能衰竭。
甲亢药物的副作用：
目前临床上常用的甲亢药分为两类，一类是甲硫氧嘧啶和丙硫氧嘧啶等硫氧嘧啶类，另一类是甲巯咪唑等咪唑类。最近媒体报道的短缺甲亢药物他巴唑和赛治属于后者。这些药能抑制甲状腺激素的分泌，主要的副作用是皮疹、头痛和关节痛，一般不会影响体重。
不过，如果患者长期、大量服用甲亢药，且在治疗中没有及时监测，出现了甲状腺功能减退(简称“甲减”)，确实可能引起体重增加。不过，这种甲减是一过性的，在医生指导下调整用药可以恢复。建议患者遵循医嘱定期到医院查血常规和肝功能，如果出现皮肤损害、皮疹、过敏、白细胞减少、肝功能受损等情况，应在医生的指导下换药或者调整用药方式。
一旦明确有甲亢，医生会告诉患者要减少运动，注意休息，增加蛋白质、脂肪摄入量，患者吃的多了又运动少，体重就上去了。同时，药物治疗以后甲亢得到控制，原来分解代谢旺盛转成了平衡，甚至合成代谢大于分解代谢，体重也会增加。
男性甲亢药物副作用：
１、一般不良反应：皮肤荨麻疹或斑疹、发热、关节或肌肉疼痛和胃肠道不适，两种药不良反应发生率相近。轻微皮肤反应，在继续用药的同时加用抗过敏药物一般可缓解，或改用另一种抗甲亢药物。严重反应者应改用其它方式治疗。如出现关节痛应停止药物治疗。
２、粒细胞缺乏：是抗甲亢药物治疗的最严重不良反应。大多数粒细胞缺乏症都发生在治疗后90天内，在开始治疗后1年或数年内仍可以发生。一旦发生必须立即停药，进一步监测粒细胞及治疗。该不良反应与甲巯咪唑呈剂量依赖性。停药后，粒细胞缺乏是可逆的。粒细胞缺乏多发生在治疗的最初数周，也可能之后发生，喉痛或发热可能是该反应的先兆。因此，有必要经常检测白细胞。
３、药物性肝脏损害：肝脏毒性反应是抗甲状腺药物的另一种重要不良反应。甲巯咪唑和丙硫氧嘧啶肝脏毒性反应机制各不相同，因此，发生肝损害时可以慎重选用另一种药治疗甲亢。
