蓝藻的暴发性繁殖是水体富营养化的直接后果，水体富营养化分为天然富营养化与人为富营养化，天然富营养化是指湖泊营养物质的天然富集，需要千年甚至万年的演化过程。据说当年诸葛亮的军队就是喝了兵士所说的“绿色的河水”，中毒而兵败川南。有关研究认为,这种“绿色的河水”就是天然富营养化造成蓝藻暴发的河水，而目前出现的蓝藻暴发主要原因是人为富营养化造成的。
随着人类对环境资源的开发利用活动日益增加，工业的发展以及城市人口的高度集中，大量含有污染物质的工业废水和生活污水未经适当处理便排入水体，使水体中氨氮、磷以及有机污染物等耗氧物质浓度的升高，增加了水中的营养物质的负荷量;而为了提高农作物的产量，施用化肥逐年增加，经过雨水的冲刷和渗透，有更多的营养物质流失而进入水中，也增加了水中的营养物质的负荷量;在水产养殖方面，为达到渔业高产，一些地区采用投放饵料的方法，这也成为水体接纳氮、磷等营养物质的主要渠道。
生物灾害安全小知识：
1：水质出现问题，长期使用纯净水或者自来水都会造成绿藻滋生
2：更换全新过滤桶，在更换后桶内硝化系统未建立，导致仅有物理过滤，无生化过滤
3：使用基肥过多，基肥瞬间释放导致藻类爆发
4：鱼虾过多，粪便排放过多导致水草无法全部吸收。
生物灾害安全小知识：
蓝藻中的项圈藻可快速产生致死因子，破坏养殖对象的鳃组织，干扰其新陈代谢的正常进行，麻痹神经，使其死亡。蓝藻中个别种不但活体带毒，而且死亡个体分解会产生生物毒素——蓝藻毒素（如微囊藻毒素）。蓝藻毒素量多时可直接造成养殖对象中毒死亡；或者即使数量少，也可通过食物链积累效应危害养殖对象，直至危害人体。
生物灾害安全小知识：
蓝藻中的项圈藻可快速产生致死因子，破坏养殖对象的鳃组织，干扰其新陈代谢的正常进行，麻痹神经，使其死亡。蓝藻中个别种不但活体带毒，而且死亡个体分解会产生生物毒素——蓝藻毒素（如微囊藻毒素）。蓝藻毒素量多时可直接造成养殖对象中毒死亡；或者即使数量少，也可通过食物链积累效应危害养殖对象，直至危害人体。
生物灾害安全小知识：
蓝藻中有些种类会产生蓝藻毒素（如微囊藻毒素）。蓝藻毒素量多时可直接造成养殖对象中毒死亡。或者即使数量少，也可通过食物链积累效应危害养殖对象，直至危害人体。
蓝藻毒素内分为很多种，通过其危害方式可分为肝毒素和神经毒素，它们是已知的会侵袭肝脏和神经的毒素，另一类毒素对皮肤有刺激作用，肝毒素是肝癌的强烈促癌剂。
生物灾害安全小知识：
1.蓝藻发生早期时要及时注换新水，调节肥水，平衡水体营养元素。再施加适量如金枯草芽孢杆菌调节水质。这种方法适用于少量蓝藻。
2.对于大量蓝藻处理，首先应该泼洒抗应激性药物，然后再使用可靠厂家的灭藻制剂杀死藻类。蓝藻死亡后需要立即喷洒如金解毒灵对水体解毒，最后用枯草芽孢杆菌进行水质调节。
3.如果蓝藻爆发量极大，还可采取物理、化学方法进行除藻，如：人工打捞、喷施化学制剂等。但是这种方法容易对水体或水生生物造成破坏，需谨慎采用。
