农作物真菌病害的种类如下：
1、白粉病
在花、果、叶及嫩枝上覆盖白色粉状物，后期在白粉物上出现散生状针头大的颗粒，颗粒由白变黄，最后变黑，这类病害通称白粉病。
2、煤污病
在叶、枝、果实表面覆盖一层煤烟状物，很易用手擦去，通称为煤污病。这种病害发生通常与蚜虫、木虱、蚧虫密切相关。
3、锈病
叶、果、枝、干上出现疣状、条状、毛状或毡状突起，后期常破裂，散出淡黄色、桔黄色、锈褐色或黑色粉状物，常称为锈病。
4、霜霉病
为害叶、果、嫩枝，以叶片最为明显，在叶片背面形成灰白色霜状物，霜状或稀或稠，叶片正面往往黄色，无明显边缘，常称为霜霉病。
5、白绢病
通常危害近土面的叶、茎、根颈，环境潮湿时产生白色绢丝状菌丝，后期产生油菜籽大小的菌核，菌核初期乳白色逐渐变黄变褐，常称为白绢病。
真菌大都具有主动性，是以孢子萌发形成的牙管或者以菌丝从伤口、自然孔口或直接侵入，高等担子菌还能以侵入能力很强的根状菌索侵入。
真菌直接侵入的典型过程为：
落在作物表面的真菌孢子，在适宜的条件下萌发产生牙管，牙管的顶端可以膨大而形成附着胞，附着胞以分泌的黏液和机械压力将牙管固定在作物的表面。然后从附着胞与作物接触的产生纤细的侵染丝，借助机械压力和化学物质的作用穿过作物的角质层。真菌穿过角质层后或在角质层下扩展，或随即穿过细胞壁进入细胞内，或穿过角质层后先在细胞间扩展，然后再穿过细胞壁进入细胞内。一般来说，直接侵入的真菌都要穿过细胞壁和角质层。侵染丝是菌丝的一种变态，穿过角质层和细胞壁以后，就变粗而恢复为原来的菌丝状。
1、噻菌铜（龙克菌）：噻菌铜（龙克菌）在防治细菌性病害时，按照500—700倍稀释喷雾或者灌根或者泼浇或者拌种、浸种，是防治蔬菜（白菜、黄瓜、番茄）、果树（柑橘）、果类（西瓜）、烟草、兰花、棉花和水稻等9大农作物12个细菌性病害的新型理想药剂。
2、噻枯唑（叶枯唑）：对防治水稻细菌性条斑病和白叶枯病有效。由于在水稻上登记时间超过30多年，水稻已经产生了很大的抗药性，叶枯唑防治效果在不断地下降。由于登记企业过多，市场竞争无序，价格非常混乱，其已处于没落状态。
3、氢氧化铜：在水稻上未曾登记，在经济作物如蔬菜（黄瓜、辣椒和西瓜）、果树（柑橘、葡萄和荔枝）和烟草登记广泛，是常见的防治蔬菜细菌性病害的无机铜制剂。在花期和幼果期比较敏感，不可与酸性农药混用，宜单独喷洒。与春雷霉素的混剂对苹果、葡萄、大豆和藕等作物的嫩叶敏感，因此一定要注意浓度，宜在下午4点后喷药。由于登记企业比较多，价格悬殊大，真假难辩，市场也极其混乱。
真菌病害与细菌病害从病状上很难区分，它们都有坏死、腐烂、萎蔫、畸形等相似病状。只有从被害作物病部所表现的不同病征来加以区分。真菌病害在被害作物病部可以看到明显的霉状物、粉状物、粒状物等病征，病征实际是真菌子实体的形态结构，是区分真菌病害的重要标志；细菌病害在湿度大时可在病部出现大小不同的黄色或白色滴状菌脓，是细菌病害特有的病征，干燥后呈水珠状、不规则粒状或发亮的薄膜。
由于受发病时期和条件的限制，如果病征不明显时，可继续观察田间病害发生情况，同时也可将病样采回实验室，用清水冲洗干净后保湿使病征充分表现，再进行鉴定。对于一些特殊症状的病害，如由细菌引起的青枯病，可进行解剖检查，观察病株组织是否有特殊的病状表现，如维管束变色情况等进行诊断。
真菌性病害可以分为三类：
1、低等真菌
大多生长在水中或土壤中，主要病害有猝倒病、根腐病、霜霉病、白锈病、疫病、绵疫病等。一般在低温(15-20摄氏度)潮湿的春秋两季发病较多。
2、高等真菌
主要病害有赤霉病、白粉病、炭疽病、叶斑病、黑斑病等。如：麦类赤霉病；花生黑斑病；葡萄、苹果、桃、瓜类、麦类、豆类、甜菜白粉病；棉花、豆类、瓜类炭疽病；苹果、梨黑星病；桃、杏缩叶病；瓜类蔓枯病；葡萄黑腐病、房枯病；苹果轮纹病、黑腐病、腐烂病、干腐病；葱叶枯病；茄子褐纹病等。病害以点发生为多，受害部位有较明显的边缘，而形成一定形状的病斑。
3、最高等真菌
引起的病害主要有黑粉病、锈病、纹枯病和立枯病等。如：禾谷类作物的黑粉病、腥黑粉病、粒黑粉病、叶黑粉病，梨、桃、苹果、葡萄、豆类、花生、葱、向日葵锈病，棉花、茄子立枯病。一般只引起局部侵染，形成点发性症状。
