EV71病毒是危害最大的手足口病病原体之一，接种疫苗是目前唯一针对病因的预防手段。即使仍有手足口病发病的可能，但可预见接种后孩子患病及引发重症的风险会大幅降低，所以说最好还是打手足口病预防针的。
中国疾病预防控制中心2016年5月发布的《肠道病毒71型灭活疫苗使用技术指南》中建议疫苗接种对象为 6月龄的易感儿童，越早接种越好。鼓励在12月龄前完成接种程序，以便尽早发挥其保护作用。对于5岁以上儿童，目前不推荐接种。
国内外尚无报道可提供权威性数据来评价该疫苗与其他疫苗同时接种的安全性，故现阶段暂不推荐EV71疫苗与其他疫苗同时接种，建议与其他疫苗接种应间隔2周及以上。
对该疫苗中的任何物质过敏者，发热、急性疾病期患者，严重慢性疾病、过敏体质者(如对蛋白质过敏)禁用；灭活疫苗技术成熟可靠，尽管该疫苗为新产品，但不良反应与其他灭活疫苗相类似。症状为偶有发热，更少见一些轻微的反应，如局部疼痛、肿胀等，一般均可自行缓解。
中国疾病预防控制中心2016年5月发布的《肠道病毒71型灭活疫苗使用技术指南》中建议疫苗接种对象为≧6月龄的易感儿童,越早接种越好。鼓励在12月龄前完成接种程序,以便尽早发挥其保护作用。对于5岁以上儿童,目前不推荐接种，对接种疫苗的孩子没有副作用。
接种禁忌：已知对EV71型手足口病疫苗任何一种成分过敏者，发热、急性疾病期患者及慢性疾病急性发作患者不得接种。如有下列情况，应在决定是否接种时慎重考虑：
1.患有血小板减少症或者出血性疾病者，肌肉注射本疫苗可能会引起注射部位出血。
2.正在接受免疫抑制治疗或免疫功能缺陷的患者，接种本疫苗产生的免疫应答可能会减弱。接种应推迟到治疗结束后或确保其得到了很好的保护。但对慢性免疫功能缺陷的患者，即使基础疾病可能会使免疫应答受限，也应推荐接种。
由于疫苗刚刚上市应用，目前尚缺乏有效的免疫持久性研究数据。根据对Ⅲ期临床研究对象的跟踪观察，接种后26个月，免前抗体阴性易感者，体内的中和抗体阳性率可达到85.7%，GMT为1:27.6，仍高于免疫学替代终点（1:16）。在上臂三角肌肌内注射，每次接种剂量为0.5ml。
接种疫苗注意事项：
1.同其它疫苗一样，因疫苗特性或受种者个体差异等因素，接种本疫苗的人群不一定产生100%的保护效果。
2.EV71疫苗可刺激机体产生针对EV71病毒的免疫力，用于预防EV71感染所致的手足口病和相关疾病，不能预防其他肠道病毒（包括柯萨奇A组16型等病毒）感染所致的手足口病。
3.接种EV71疫苗与注射人免疫球蛋白应至少间隔1个月以上，以免影响免疫效果。
孩子在接受注射手足口病疫苗时，要切记不能吃辛辣、生冷等具有刺激性的食物，这个时候往往还会引起手足口病反应，所以小孩子注射完疫苗后，应忌口，父母方面要做好监督工作，小孩子不懂，父母不能跟着犯傻，以免小孩一时贪嘴，不仅令疫苗失去作用，反而还惹病上身。另外，手足口病疫苗注射后，家长应时刻观察小孩的情况，看孩子是否有过度反应，如果发现发烧发热现象较严重，应立马送去医院就诊。
别以为注射了手足口病疫苗就可以放下心来，也有注射手足口病疫苗后仍然患手足口病的案例。在此病的高发期，更应注意孩子生活用品的卫生，例如吃饭用的碗筷、玩具玩偶、枕头被单，特别是孩子经常放到嘴里允吸的物件应消毒干净，最好是分开单独消毒，这样能更彻底的消灭病菌，减少细菌寄生的可能性，同时家里还要保持空气流通、新鲜。
