因应近期食品安全风暴，台湾当局领导人马英九10月20日晚主持召开第二次高层安全会议。马英九办公室表示，劣质食用油事件重创台湾食品产业，预估受冲击的产值达新台币166.6亿元，显见此一事件已事关台湾安全问题。
马英九指出，食安问题不仅造成相关产业损失重大，更动摇民众对食品安全的信心，重创台湾的国际形象，所产生的影响甚大。
他说，“行政院”成立食品安全办公室，就是希望藉由跨“部会”的常设性编制与专责人员，有效发挥统筹、整合、协调的功能。
马英九表示，解决食安问题“是一项长期的抗战”，当局有信心也有决心以清仓式、地毯式查缉的办法，消灭所有盲点、死角、漏洞，一步步切实做好食品安全的把关工作，尽快恢复民众的信心。
他也强调当局要藉此机会痛定思痛、化危机为转机，推动前所未有的改革，从源头、通路到零售，从上游、中游到下游，全面检视台湾的食品供应网，确定目标、统一步伐、分工合作、全力以赴。
马英九并指示“警政署”尽快规划项目，全力清查台湾食品相关地下工厂，同时给出在一个月内清查完毕的时间表。
