1、棉花立枯病的危害：棉立枯病俗称烂根病、黑根病，全国各棉区均有发生，棉苗受害后，在近地面的茎基部产生黄褐色病斑，后变成黑褐色，并逐渐凹陷腐烂，严重时病部变细，病苗枯死或萎倒。子叶受害后形成不规则形黄褐色病斑，以后病部破烂脱落成穿孔状。成株期受害后，叶上产生褐色斑点，后脱落穿孔。
2、棉花枯萎病的危害：枯萎病也叫植物的癌症，是棉花生产的大敌，近年来，迅速蔓延。枯萎病的特征是：植株矮化，叶色发灰绿色，脆硬，茎杆弯曲，茎结缩短，顶心下陷，茎杆内维管束变成灰褐色或浅黑色。发病条件：高温高湿，连茬种植，雨后晴天，会成行、成片死亡。
3、棉花黑腐病的危害：黑腐病棉花根部表皮呈黑色，略有凸起，无新根长出，植株矮小、叶片软绵、生长缓慢，高温下易死亡，死亡后植株呈黑枯形，直立不倒，发病区呈块状。雨后积水时间长，地势低洼，盐碱偏重或施氮肥量大的地块，中耕不及时，前茬种过甘薯、甜菜、大白菜、甘蓝、萝卜地块易发此病。
1、棉花黑根病、烂根、腰折病。
主要为害棉苗。侵染幼茎茎基部初现纵褐条纹，条件适宜时迅速扩展绕茎一周，缢缩变细，出现茎基腐或根腐。棉苗失水较快，一般不倒伏。死苗易从土中拔除，基部或根系上可见稀疏的丝状物及粘附在其上的小土粒。侵染种子引起烂种或烂芽，病种子多呈褐色软腐状，挤压时流出黄褐色粘液。侵染子叶及幼嫩真叶形成不规则褐色坏死斑，后干枯穿孔。湿度大时病部可见稀疏白色菌丝体，并有褐色的小菌核粘附其上。
2、棉苗炭疽病
苗期、成株期均可以染病。苗期染病：发芽后出苗前受害可造成烂种；出苗后茎基部发生红褐色纵裂条斑，扩展缢缩造成幼苗死亡。潮湿时病斑上产生橘红色粘状物（病菌分生孢子）。子叶边缘出现圆或半圆形黄褐斑，后干燥脱落使子叶边缘残缺不全。
1、选种晒种
棉苗病害，如炭疽病菌多以生孢子和菌丝体在种子内外越冬。播种前必须精选种子，汰除烂籽、病虫籽和杂籽，还须抢晴天将种籽曝晒1～2 d，以杀死种籽上所带的部分病菌，提高种籽质量，促进种籽后熟，便于提高种籽发芽率，促进苗齐，苗壮而病轻。
2、精细整地,开好排水沟
整地前全面、彻底清理棉田周围的枯枝落叶和烂铃，是防治炭疽病、立枯病等病害的有效措施。翻地前施足基肥，地要整平整细，以利出苗。棉田要开好排水沟，特别是地势低洼棉田，要做到深沟高畦，尤其是南方棉区，春季雨水多，地下水位高，深沟高畦有利于排水，降低土壤湿度，收到防病保苗效果。
3、适时播种
迟播，不利于棉苗生长；早播，气温、土温偏低，出苗太慢，有利于病菌侵入为害。通常以5 cm土温稳定在12℃以上为播种适期，即长江流域棉区最佳播种期为4月中旬，华北棉区最佳播种期为4月下旬。
