孕期吃药并不一定会造成胎儿畸形，这也是根据孕妇自身体质及用药来决定的。
第一类：(不敏感期)：这个不敏感期指的主要是受精后2周内期间，也就是通常所说的受精卵着床前期，因为这个期间受精卵与母体组织尚未真正的接触，因此受用药对其影响不大。所以在此期间使用药物几乎不存在导致胎儿畸形的危害，因此不必过分的担心和决定做人工流产。
第二类：(敏感期)：受精后3~8周期间，一般被称为致使胎儿畸形的敏感期，因为这个阶段是胚胎各器官分化形成的重要时期，容易受到外部因素的影响，如果是必须用药的情况，一定要遵从医生的要求谨慎用药。如果使用过药物，需要做产检的时候，通过专业的仪器来明确胎儿生长发育情况是否正常或者存在畸形的可能。
在怀孕早期得了感冒、发烧，或者炎症感染，有些药物还是相对比较安全的，比如说像青霉素、头孢类的药物，在妊娠早期或妊娠期使用是相对安全的。所以，有些孕妇感冒了、发烧了，扛着不用药，因为怕用药以后影响胎儿，实际上这种想法是不对的。
卵子在体内可以存活2-3天，精子则可以活48小时，从受精到着床，形成胚胎，这段时间服用了一些药物，对胎儿不会有太大的影响，不必过分担心。原因有以下两点：
(1) 在卵子受精后1周内用药，受精卵尚未种植在子宫内膜，一般不受药物影响;
(2) 如受精1-2周内用药，受精卵已种植于子宫膜，但组织尚未分化，药物产生的影响除流产外，并不引致畸形，属安全期。
服用药物后对胎儿影响最大的关键期是在受孕后的3-12周左右，因为此时胚胎、胎儿各器官处于高度分化、迅速发育阶段，在这个时候使用一些药物，可能影响胎儿的某些系统和器官畸形。
妊娠后，孕妇体内酶有一定的改变，对某些药物的代谢过程有一定的影响。药物不易解毒和排泄，可有蓄积性中毒，在孕早期胎器官形成时，药物对胎儿有一定的影响。
孕早期病毒感染性疾病和不恰当的用药都可能影响胎儿脑细胞的发育。
国内外的临床研究证明，准妈妈如患有不同类型的甲减，会使准妈妈流产和妊娠期并发症显着增加，更重要的是，准妈妈甲减会造成胎儿脑发育障碍，导致后代智商下降6-8分。
据有关统计表明，90%的孕妈咪在妊娠期间曾服用过至少一种药物，4%的孕妈咪表示在孕期至少服用过10种药物。这个结果是不是让你很吃惊?
我们都知道是药三分毒，不少孕妈仍然存在“久病成医”的固执，生病之后不请教专业的医生，直接按照往常的惯例进行处理，而某些药物成分可以通过胎盘屏障，直接影响胎儿发育，也有可能导致脑发育不全，影响宝宝的聪明。结果正是这些疏忽大意造成胎儿的畸形，严重者甚至流产。
许多药物可以由孕妇的血液经胎盘进入胎儿体内，直接对胎儿产生毒性作用，特别是在妊娠的头3个月，因受精卵正处于分化阶段，各系统还没有形成，正处于发育阶段，胚胎细胞受到化学药物的作用，就可能诱发遗传物质突变，导致胎儿畸形。
例如：
四环素类药，尤其是四环素能抑制胎儿骨质合成，在妊娠早期使用四环素可致胎儿四肢畸形，先天性白内障，妊娠4个月以后使用可致胎儿骨骼和牙齿发育障碍;
卡那霉素、庆大霉素、链霉素可使胎儿听神经受到损伤，造成先天性耳聋;
解热镇痛药阿司匹林、氨基比林等可造成胎儿中枢神经系统和肾脏畸形;
大剂量皮质激素(强的松)可制胎儿多发性畸形，如唇裂和腭裂;
性激素可致胎儿内分泌改变，如丙酸睾妨素可使女性胎儿外生殖器男性化;
